Cuando generas un Cobro desde Asientos, la contrapartida aparece en el asiento generado solo si has seleccionado una factura. Si generas un asiento de cobro con más de una factura (sea del mismo cliente o no), ya no aparece relleno el campo de Contrapartida en el asiento. Sería interesante que siguiese apareciendo, y más cuando solo puedes generar el asiento usando la misma cuenta bancaria para todos los apuntes que incluyas en dicho Cobro.