Cuando una factura de ventas es aceptada por AEAT en el SII, no te permite modificar el asiento, como es lógico, pero tampoco te deja añadir una cuenta analítica (que no afecta al IVA ni a las cuentas implicadas) si quieres añadirla con posterioridad. En cambio, sí te permite cambiar la cuenta analítica si existe alguna.
Tras enviar la sugerencia, hemos comprobado que sí es posible hacer estas modificaciones utilizando en el asiento la opción "Modificar asiento enviado al SII": si marcas que NO se van a modificar los datos que afectan al SII, puedes hacer cambios en cuentas de venta y analitica, por lo que el problema queda solucionado. Muchas gracias